Tahun 2006, aula Sekolah Menengah Jujutsu Prefektur Tokyo bergema dengan pertengkaran tanpa henti dan perdebatan sengit antara dua sahabat karib yang tak terpisahkan. Dengan kepercayaan diri yang tak tergoyahkan, Satoru Gojou dan Suguru Getou percaya bahwa tidak ada tantangan yang terlalu besar bagi penyihir muda dan kuat Tingkat Khusus seperti mereka. Mereka ditugaskan untuk mengantarkan seorang gadis yang bijaksana bernama Riko Amanai kepada entitas yang keberadaannya merupakan inti dari dunia jujutsu. Namun, misi tersebut menjerumuskan mereka ke dalam pusaran konflik moral yang melelahkan yang mengancam untuk menghancurkan persahabatan yang sudah lemah antara penyihir dan manusia biasa. Dua belas tahun kemudian, siswa dan penyihir menjadi garda terdepan pertahanan melawan meningkatnya jumlah kutukan tingkat tinggi yang lahir dari emosi negatif manusia. Seiring bertambahnya kekuatan entitas, kesadaran diri dan ambisi mereka juga meningkat. Kutukan-kutukan tersebut bersatu untuk tujuan bersama yaitu membasmi manusia dan menciptakan dunia yang hanya dihuni oleh pengguna energi terkutuk, dipimpin oleh roh terkutuk kuno yang berbahaya. Untuk menyingkirkan rintangan terbesar mereka—penyihir terkuat, Gojou—mereka merencanakan serangan di Stasiun Shibuya pada malam Halloween. Terbagi menjadi beberapa tim, para penyihir memasuki pertempuran dengan siap mempertaruhkan segalanya untuk melindungi orang-orang yang tidak bersalah dan kaum mereka sendiri.